世界，一開始是混沌的。 生命的起源，創世神——阿爾宙斯創造了這個世界，存在于世界的另一面暗世界中，暗之魔龍冥王龍也隨之誕生。 阿爾宙斯創造了空間之神帕魯奇亞與時間之神帝牙盧卡，代表著宇宙的誕生。 為了封印住暗之魔龍的力量，出現了三股新的光芒。它們分別是知識之神由克希、感情之神艾姆利多和意志之神亞克諾姆。 就在這時，夢境出現了。 代表美夢美夢之神克雷色利亞與代表噩夢的噩夢之神達克萊伊被創造出來了，他們讓神奇寶貝擁有了夢。 火的代表鳳凰與其的三大守護使者，水的代表洛基亞與其的三大守護神鳥，光的代表雷希拉姆、暗的代表捷克羅姆、冰與龍的代表酋雷姆，紛紛出現。 高翔于萬空之上的天空之龍烈空坐；隱沒于海底深處的海之帝王蓋歐卡；盤踞于大地的最終王者固拉多，也出現在了這個世界。 大地的編造者雷吉奇卡斯，據說是有著能拉動大陸的強大力量，它用巖石、寒冰和鋼鐵創造出了三只與自己形態相似的神奇寶貝，他們分別是巖神柱、冰神柱和鋼神柱。 幻獸神奇寶貝也出現了！ 所有神奇寶貝的初始者夢幻、沉睡于世界某一個角落的千年許愿星吉拉祈、被眾神遺棄于宇宙之中而導致變異的異類生物代歐奇稀斯、被時之神所創造，時間與森林的守護者雪拉比、滄海的王子，海之幻獸瑪娜菲、兩只雙胞胎的無限神奇寶貝拉帝歐斯、拉帝亞斯、火山的守護者火山神席多藍恩、天空的守護者潔米、音樂之神美洛耶塔與三朵強大的云龍卷云、雷電云和土地云、凱路迪歐與三劍士勾帕路翁、代拉基翁和畢力吉翁。 最后的最后，便是勝利之神比克提尼！ 于是，精靈世界便誕生了。